Eugene Myers

Eugene Myers Imagem na Infobox. Biografia
Aniversário 31 de dezembro de 1953
Boise
Nacionalidade americano
Treinamento Instituto de Tecnologia da Califórnia,
Universidade do Colorado,
Universidade do Colorado em Boulder
Atividades Bioinformático , cientista da computação
Outra informação
Trabalhou para Universidade do Arizona , Universidade da Califórnia em Berkeley
Campo Ciência da Computação
Membro de Academia Leopoldina
Supervisor Andrzej Ehrenfeucht
Prêmios

Eugene Wimberly "Gene" Myers Jr. , nascido em31 de dezembro de 1953em Boise ( Idaho ), é um cientista da computação americano , conhecido por seu trabalho em bioinformática . Ele é um dos criadores do programa de sequenciamento de DNA da Ferramenta de Busca de Alinhamento Local Básico (BLAST) e contribuiu com outros algoritmos importantes para o Projeto Genoma Humano e outros projetos importantes de sequenciamento do genoma.

Biografia

Myers estudou matemática no California Institute of Technology com um diploma de bacharel e na University of Colorado em Boulder , onde obteve um Ph.D. em 1981 sob a supervisão de Andrzej Ehrenfeucht ( A Depth-First Characterization of k- Connectivity and Its Aplicativo para teste de conectividade ). Durante seus estudos, ele também trabalhou na Bell Laboratories e no National Center for Atmospheric Research em Boulder .

De 1981 e por 17 anos, Myers foi professor assistente na Universidade do Arizona , onde trabalhou em algoritmos de comparação de sequências de DNA. De 1999 a 2002, ele foi vice-presidente de pesquisa em ciência da computação na Celera Genomics em Rockville, Maryland, que foi fundada no ano anterior, e de 2003 a 2005, ele foi professor de ciência da computação e biologia molecular na Universidade da Califórnia em Berkeley . É então diretor de um grupo de pesquisa na Campus Janelia Farm Research  (em) o Instituto Howard Hughes Medical (HHMI) em Loudoun County na Virginia .

Myers é desde 2012 um dos diretores do Instituto Max-Planck de Biologia Celular Molecular e Genética (MPI-CBG); a partir de 2017 e por dois anos, Myers se torna Diretor Executivo da MPI-CBG. Desde sua chegada a Dresden na cátedra Klaus-Tschira da universidade em 2012, ele também dirigiu o centro de biologia de sistemas (CSBD) criado pelo MPI-CBG e o Max-Planck-Institut für Physik komplexer Systeme (MPI -PKS ) em 2010, em cooperação com a Fundação Klaus Tschira e a Universidade Técnica de Dresden .

Trabalho científico

Myers e seus co-autores desenvolveram o programa BLAST para análise de sequência no final dos anos 1980 . Seu artigo é um dos trabalhos mais citados da década de 1990, o programa BLAST continua a ser usado para comparar sequências de DNA em sequências acessíveis em grandes bancos de dados.

Na Celera Genomics Myers participou do desenvolvimento de algoritmos no sequenciamento shotgun de recomposição dos 3 bilhões de pares de bases do genoma humano a partir de pequenas partes e, assim, permitiu a conclusão do projeto muito antes do esperado. Resultados semelhantes também foram obtidos, em pesquisa pública, por seu ex-colega David Haussler do Colorado na Universidade da Califórnia em Santa Cruz , Eric Lander no MIT e outros.

Myers também participou do projeto de sequenciamento do genoma da Drosophila liderado por Gerald Rubin  (em) , o diretor do Campus de Pesquisa Janelia, e o mouse. Nos anos de 2005-2012, ele trabalhou como diretor de grupo no Campus de Pesquisa Janelia em um projeto que permite a análise de fotos microscópicas de cérebros de ratos e moscas do ponto de vista neuroanatômico.

Com Udi  (en) , Myers desenvolve a estrutura de dados do array de sufixos . Myers também é o autor do algoritmo diferente do GNU .

Distinções e afiliações

Desde 2006, Gene Myers é membro da Academia Alemã de Ciências Leopoldina  ; desde 2016 é membro da Organização Europeia de Biologia Molecular .

Apêndices

Bibliografia

Notas e referências

  1. Jones e Pevzner 2004 , Biografia nas páginas 333 ff.
  2. (em) "  Eugene Wimberly Myers, Jr.  " , no site do Mathematics Genealogy Project .
  3. "  diretório MPI-CBG  "
  4. Zentrum für Systembiologie .
  5. Center for System Biology Dresden abre Max-Planck-Gesellschaft.
  6. Stephen F. Altschul, Warren Gish, Webb Miller, Eugene W. Myers e David J. Lipman, “  Basic local align search tool  ”, J. Mol. Biol. , vol.  215, 1990, p.  403-410 ( ler online , consultado em 7 de outubro de 2018 ).
  7. Google lista 74.123 citações.
  8. Jones e Pevzner 2004 , History nas páginas 333 ff.
  9. Udi Manber e Gene Myers , “  Suffix Arrays: A New Method for On-Line String Searches,  ” SIAM Journal on Computing , vol.  22, n o  5,1993, p.  935-948 ( ISSN  0097-5397 , DOI  10.1137 / 0222058 ).
  10. Visão geral do GNU diff .
  11. (em) Eugene W. Myers, "  An O (ND) Difference Algorithm and Its Changes  " , Algorithmica , vol.  1,1986, p.  251-266 ( DOI  10.1007 / BF01840446 ).
  12. (em) Webb Miller e Eugene W. Myers, "  A File Comparison Program  " , Software-Practice and Experience , Vol.  15,1985, p.  1025–1040 ( DOI  10.1002 / spe.4380151102 ).
  13. O algoritmo foi descoberto e descrito de forma independente (em) Esko Ukkonen, "  Algorithms for Approximate String Matching  " , Information and Control , Vol.  64,1985, p.  100-118 ( DOI  10.1016 / S0019-9958 (85) 80046-2 ).
  14. Eugene W. Myers em Leopoldina .

links externos