Lista de tipos de DNA
Dependendo de sua função, sua localização, as modificações químicas que sofreram, ou o uso que é feito deles em laboratórios, nomes particulares são atribuídos a certos DNAs, dos quais aqui está uma lista não exaustiva:
- DNA anti-sentido: fita complementar (portanto, anti ) do locus considerado. Por exemplo, no caso de um gene, esta é a fita não transcrita.
- DNA Loan gapped (in (in) gapped DNA ): Molécula de DNA de fita dupla tendo uma ou mais regiões de fita simples.
- DNA biotinilado: molécula de DNA marcada com biotina pela incorporação de um nucleotídeo biotinilado (geralmente uracila) na molécula de DNA. A detecção de DNA marcado é conseguida formando um complexo com estreptavidina ao qual foi anexado um agente corante, como peroxidase, que dá uma cor verde fluorescente como resultado da reação com diferentes reagentes orgânicos.
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DNA quimérico , DNA recombinante ou DNA recombinante : DNA constituído por fragmentos de várias origens.
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DNA circular : uma molécula de DNA circular , portanto sem extremidade livre.
- DNA circular fechado covalentemente ou ccDNA (DNA circular fechado covalentemente): Molécula de DNA cujas extremidades livres são ligadas para formar um círculo. Os fios permanecem amarrados mesmo após a desnaturação. Os plasmídeos ocorrem nesta forma in vivo. Em sua forma nativa, o ccDNA se adaptará a uma configuração superenrolada.
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DNA do cloroplasto : DNA encontrado no cloroplasto . Embora o cloroplasto tenha um genoma pequeno, o grande número de cloroplastos por célula implica uma proporção significativa de DNA do cloroplasto em comparação com o DNA total de uma célula vegetal.
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DNA complementar ou cDNA : DNA de fita simples, que é uma cópia de um RNA obtido por transcrição reversa. O cDNA de fita dupla resulta da cópia da primeira fita pela DNA polimerase.
- DNA complementar de fita dupla ou cDNA : uma molécula de DNA de fita dupla produzida a partir de um molde de cDNA.
- DNA desnaturado: DNA de fita dupla que foi convertido em fita simples quebrando as ligações de hidrogênio entre pares de nucleotídeos complementares. Freqüentemente reversível. Normalmente obtido por calor.
- DNA de fita dupla ou DNA duplex ou dsDNA : duas fitas complementares de DNA unidas na forma de uma dupla hélice.
- DNA egoísta (em DNA (in ) egoísta ) de sequências de DNA genômico que são capazes de se replicar e traduzir, mas não conferem nenhuma vantagem à célula. Falamos de DNA egoísta ou parasita genético porque sua atividade serve apenas para garantir sua própria persistência por gerações.
- DNA spacer (en (en) spacer DNA ): sequência de DNA não transcrito, separando genes dentro de unidades de repetição.
- DNA estranho ou exógeno: DNA de um organismo presente (ou a ser introduzido) em outro organismo, podendo ou não estar integrado ao genoma deste.
- DNA heterólogo (heteroduplex): DNA de fita dupla formado pelo emparelhamento de duas fitas de origem diferente; apresenta domínios em loops nas zonas onde os emparelhamentos não são feitos corretamente.
- Homoduplex de DNA: uma molécula de DNA de fita dupla totalmente complementar.
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DNA híbrido : molécula de DNA composta por duas fitas de origens distintas.
- DNA linker (en (en) linker DNA ): fragmento de DNA sintético (feito de uma forma química e não biológica) que é usado para ligar duas moléculas de DNA; este DNA de ligação (ligante) geralmente contém um local de clivagem para uma enzima de restrição. O termo ligação ao DNA também se refere aos segmentos de DNA (55 pares de bases ligados às histonas) localizados entre dois núcleos nucleossômicos na fibra da cromatina.
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DNA mitocondrial ou mtDNA : DNA encontrado nas mitocôndrias. Em mamíferos, o mtDNA representa menos de 1% do DNA total, mas em plantas a quantidade é variável. Ele codifica rRNAs, tRNAs e algumas proteínas mitocondriais, muitas vezes essenciais para a respiração celular (até 30 em animais).
- DNA móvel ( transposon ): elemento transponível ou “gene jumper” ou transposon de DNA; sequência de DNA móvel que pode conter genes de bactérias (como genes de resistência a antibióticos); Fragmento de DNA capaz de se mover ao longo de uma molécula de ácido desoxirribonucléico. Entre os transposons estão sequências de inserção, DNAs de fago e elementos de controle.
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DNA não repetitivo : sequências de DNA presentes no genoma em um pequeno número de cópias. Este DNA exibe a cinética de reassociação esperada para sequências únicas e é caracterizado por um alto valor de Cot (concentração de DNA de fita dupla em função do produto da concentração total de DNA (Co) pelo tempo de incubação (t) em condições específicas) .
- DNA transportador (em (in) DNA transportador ): DNA de sequência desconhecida que é adicionado ao DNA transformador ( plasmídeo ) usado nos procedimentos de transferência física de DNA. Este DNA adicional aumenta a eficiência da transformação por eletroporação e métodos químicos. O mecanismo de ação é desconhecido.
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Junk DNA (em (in) Junk DNA ) nome pejorativo dado a regiões não codificantes de um genoma.
- DNA ribossomal: locus que codifica o RNA ribossômico. É geralmente um locus grande e complexo, normalmente composto por um grande número de unidades repetidas separadas umas das outras por um espaçador intergênico. Uma unidade de repetição contém uma cópia do gene para cada RNA ribossômico constituindo ribossomos , separados uns dos outros por um espaçador transcrito interno. Nas células eucarióticas, essas sequências que carregam os genes responsáveis pela síntese do RNA ribossomal (rRNA) estão presentes no DNA dos organizadores nucleolares (no nucléolo); com exceção do rDNA 5S (que é nucleoplasmático).
- DNA satélite: corresponde a blocos de sequências repetidas, com comprimento de 5 a 2.000 bp (bp = pares de bases) correspondendo a um tamanho total de 100 Kb a aproximadamente 5.000 Kb, localizados principalmente ao nível dos centrômeros, e não transcritos. É o DNA da heterocromatina centromérica localizada em todos os cromossomos. Sua função é fixar inúmeras proteínas do centrômero envolvidas na função de organização e segregação dos cromossomos durante a mitose.
- DNA de fita simples ou ssDNA (en (en) DNA de fita simples ): moléculas de DNA separadas de sua fita complementar, após sua ausência ou desnaturação.
- DNA fonte: DNA de um organismo que contém um gene alvo e usado como material inicial em um experimento de clonagem.
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ADN super-enrolado ou super-helicoidal do ADN ou super-helicoidal do ADN: ADN possuindo uma super-enrolado configuração.
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T-DNA : segmento de DNA do plasmídeo Ti ou Ri, presente nos patógenos Agrobacterium tumefaciens e A. rhizogenes , transferido para células vegetais e inserido em seu DNA, formando assim parte do processo de infecção. O T-DNA de tipo selvagem codifica enzimas que induzem nas plantas a síntese de opinas específicas necessárias para o crescimento bacteriano. Em T-DNAs modificados, esses genes são substituídos por um (s) transgene (s).
- DNA de fita tripla: composto por uma fita de DNA e duas fitas de APN ( ácido nucleico do peptídeo ), que é uma forma de ácido nucleico artificial e que pode ser suspeita de ser a fonte do DNA ou do RNA.
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