Huningue é uma passagem ideal para os invasores e sua história que se funde com a de toda esta região fronteiriça sofreu 3 cercos durante as guerras da Revolução Francesa e do Primeiro Império
“As cabeças de ponte de Huningue, Khell, Cassel , etc. proporcionou essas grandes vantagens ao exército francês durante a última guerra. "
- Simon François Gay de Vernon , tratado elementar sobre arte militar e fortificação
Em 1796, o arquiduque Carlos empurrou o exército do Reno para além do rio, fora das cabeças de ponte de Kehl e Huningue. Ele empreende o cerco de Kehl e envia o tenente-general Karl Aloys zu Fürstenberg para sitiar Huningue com 20.000 homens. A guarnição francesa, com 3.000 homens, é substituída a cada 10 dias. É comandado pelo General Jean Charles Abbatucci . Os austríacos montaram suas baterias entre o 4º e o12 de novembro e fazer uma série de trabalhos de abordagem até 24 de novembrosem que a artilharia francesa conseguisse impedi-los. Após dois bombardeios maciços em 24 e28 de novembro, o general austríaco convoca os franceses a se renderem, o que eles recusam. No entanto, a ponte sobre o Reno foi destruída e os sitiados foram abastecidos apenas por barcos. O30 de novembro, após um forte canhão, os austríacos atacaram com 6.000 homens. Eles capturam um posto avançado francês, mas são empurrados para trás na frente da estrutura principal. Abatucci ordenou um contra-ataque e assumiu o posto avançado, mas foi mortalmente ferido: morreu no2 de dezembro. O general Georges Joseph Dufour o sucede. Depois de uma pausa, o fogo de artilharia recomeçou.13 de dezembro. O frio intenso que se instala congela o solo e dificulta o trabalho nas valas por algumas semanas. Os sitiados sofrem com a falta de moradias, destruídas pelos bombardeios, e de combustível. A rendição de Kehl, o10 de janeiro, permite que os austríacos concentrem seus recursos em Huningue. De 17 a28 de janeiro, eles cavam trincheiras de aproximação, os dois campos trocando tiros de artilharia. Durante a noite de 28-29, os franceses fizeram uma nova surtida e destruíram algumas peças de artilharia inimiga. Repetem esta operação na noite de 30 para 31.31 de janeiro, O arquiduque Charles chega ao acampamento austríaco, trazendo com ele a artilharia pesada e as bombas que foram implantadas na frente de Kehl. O 1 st fevereiro ao meio-dia, General Dufour, que realizou um conselho de guerra, decidiu capitular. Um acordo é assinado durante o dia: a fortaleza é entregue em5 de fevereiro, a guarnição retirando-se para a França com armas e bagagem. Este cerco de três meses e meio, contra uma fortaleza considerada menor, custou aos austríacos muitos homens e munições e contribuiu indiretamente para o sucesso do exército francês na Itália no cerco de Mântua .
Durante a campanha na França, o coronel Jean-Hugues Chancel do exército napoleônico, entrincheirado em Huningue, resistiu três meses e meio contra os bávaros do general Friedrich von Zoller . O cerco começa em21 de dezembro de 1813 e termina em 15 de abril de 1814.
O ato de rendição, assinado em 14 de abril de 1814para Bourglibre (nome republicano de Saint-Louis ), especifica que:
Durante a Sétima Coalizão , Huningue foi sitiada pela terceira vez em 26 de junho por 20.000 austríacos. O general Barbanègre , chefe de uma guarnição de menos de 400 homens, toma a cidade por 2 meses enquanto Napoleão abdicava por quase 20 dias. Quando se rendeu em 26 de agosto , a cidade não passava de uma ruína.
“Huningue (28/07/1815-26/08/1815): General Joseph Barbanègre que comanda a guarnição de Huningue (100 artilheiros, 30 isolados, 5 gendarmes, 140 aposentados e 120 oficiais alfandegários, ao todo 395 homens) se recusa a reconhecer o armistício e ele foi sitiado a partir de 28 de julho de 1815 pelas tropas do arquiduque João (15.000 homens). Em 14 de agosto, a trincheira foi aberta e 176 peças incendiaram a cidade sem intimidar a guarnição. Convocado a se render em nome de Luís XVIII, Barbanègre hastea a bandeira branca, mas se recusa a entregar o lugar no exterior. Finalmente, ele capitulou em 26 de agosto, com a condição de que a guarnição se juntaria ao exército do Loire. Cerca de uma centena de homens saudáveis, o resto da guarnição, marcha orgulhosamente ao lado do arquiduque João e dos atônitos austríacos. "
- Alain Pigeard , Dicionário das batalhas de Napoleão: 1796-1815
O Tratado de Paris estipulará, em seu artigo III, que as fortificações de Huningue serão arrasadas sem que possam ser restabelecidas ou substituídas por outras obras a menos de três léguas da cidade de Basel . Essas disposições levarão ao desmantelamento da cidade Vauban de Huningue.