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Ordens de classificação inferior
As Actinobactérias , francesas Actinobactérias, são um grupo de eubactérias filamentosas Gram-positivas . A maioria dessas espécies, em vez de viver em liberdade, evoluíram para se tornarem comensais e / ou simbiontes de plantas, fungos, insetos, esponjas e outros organismos ... ou são saprofíticas e principalmente telúricas; alguns (por exemplo, Mycobacterium ) podem ser patogênicos em indivíduos com resistência enfraquecida. Alguns vivem dentro de plantas para as quais fixam nitrogênio no ar e produzem antibióticos naturais.
Eles eram anteriormente chamados de actinomicetos , o sufixo fungo que se refere às características que eles têm em comum com os cogumelos, mas para evitar confusão com os cogumelos, agora é chamado de Actinobacteria.
Essas bactérias são conhecidas por serem anaeróbicas, enquanto nocardia (como os estreptomicetos que se assemelham a elas) são aeróbias . Alguns casos de actinomicetos aquáticos aeróbios (de água doce) foram relatados em 1975 no Canadá por dois microbiologistas.
Com as cianobactérias , secretam, ao produzir esporos , a geosmina que dá ao solo o cheiro de terra recém- revolvida ou úmida após um período de seca.
Essas bactérias ocupam dois tipos muito diferentes de habitats:
A maioria das Actinobactérias são aeróbias , mas algumas, como a Actinomyces israelii, suportam as anaeróbias .
O grupo de actinomicetos e Nocardia tem sido freqüentemente apresentado como bactérias e fungos abrangendo. Foi descrito por alguns entre as infecções fúngicas , por outros entre as infecções bacterianas.
Na verdade, é semelhante aos fungos apenas pela existência de filamentos ramificados que evocam um micélio. A semelhança é apenas morfológica, a filogenia molecular mostrou claramente que o grupo pertence às Eubactérias ; esta filogenia é morfologicamente suportada pela finura desses filamentos (máximo de 1 mícron, os filamentos miceliais variando de 2 a 5 mícrons) e pelo fato de, principalmente em cultura, esses filamentos se fragmentarem a ponto de se assemelharem a bacilos (aspecto semelhante ao de Corynebacterium ). Além disso, a composição de sua parede e correlativamente sua sensibilidade aos antibióticos os aproximam das eubactérias .
Muitas actinobactérias têm formas filamentosas que lembram micélios de fungos , onde foram originalmente classificadas com o nome antigo de Actinomicetos .
Ao contrário de Firmicutes , outros grandes grupos de bactérias gram-positivas, eles têm uma alta porcentagem de CG e algumas espécies produzem exosporos .
Essa família de bactérias é diversa e produz muitas moléculas de interesse para a agricultura, biotecnologia e medicina, incluindo a maioria dos antibióticos usados atualmente em clínicas. No entanto, algumas Actinobactérias podem ser patogênicas, o que deve fazer com que sejam usadas com cautela se estiverem vivas e em humanos ou animais; mas este gênero também exibe uma capacidade incomparável de produzir numerosos compostos orgânicos complexos que são freqüentemente de interesse farmacêutico .
Em particular,
Durante uma análise metagenômica de amostras de saliva humana foi descoberta recentemente (publicação 2016) uma minúscula bactéria parasita da bactéria Actinomyces odontolyticus . O RNA dessa bactéria já havia sido relatado, mas ninguém sabia de qual organismo ele poderia ter vindo. Este microparasita bacteriano possui um patrimônio genético muito pequeno (cerca de 700 genes, em comparação com os 2200 genes de A. odontolyticus ). Parece ser altamente dependente de seu hospedeiro (casal A. odontolyticus + ser humano neste caso). A sua presença, de facto, observada há vários anos, já estava associada a certas formas de gengivite , fibrose cística e mecanismos de resistência antimicrobiana , mas sem que a bactéria tivesse sido identificada como organismo parasita e sem que a sua biologia fosse incluída. Como no caso da única outra bactéria parasita conhecida de arquéias ( Bdellovibrio , descoberta um pouco antes e classificada entre as “ Delta Proteobacteria ”, uma célula muito móvel e rápida livre , que rastreia arquéias para parasitá-las. Além de possuir um gene genético herança, pelo contrário, maior do que a média para bactérias deste tamanho. A "nova bactéria salivar", muito menor do que a maioria das outras bactérias, também pode viver na superfície de sua bactéria hospedeira; ela tem uma constituição genética anormalmente pequena que também torna-o muito dependente de seu hospedeiro. É útil para seu hospedeiro, mas, em última análise, patogênico para ele e, indiretamente, também para humanos. Essas características nunca foram encontradas em uma bactéria.
Parece que, a princípio, os hospedeiros (Actinomyces) toleram esses microparasitas que se fixam na membrana externa do hospedeiro absorvendo nutrientes através da membrana , depois o parasita ataca e mata o hospedeiro ao perfurar essa membrana. É por isso que essa espécie não havia sido descoberta (porque não pode ser cultivada em placa de Petri independentemente de seu hospedeiro Actinomyces ; o que sugere que muitas outras bactérias parasitas poderiam existir sem terem sido descobertas, pelo mesmo motivo, porque muitos índices (genéticos em particular) pleiteiam interações duradouras entre micróbios, parasitas em particular).
Patogenicidade : este microparasita pode estar direta ou indiretamente ligado a certas doenças porque níveis mais elevados de seu DNA foram encontrados em pacientes que sofrem de doença gengival ou fibrose cística. Os Actinomyces são conhecidos por serem potencialmente patogênicos para a gengiva, mas normalmente são controlados por glóbulos brancos ( macrofagia ), mas parece que as bactérias infectadas pelo parasita podem escapar dos macrófagos (por um mecanismo ainda não esclarecido), o que permitiria a impunidade ao desenvolver nas gengivas.
Resistência aos antibióticos : curiosamente, as duas únicas bactérias parasitas (outras bactérias) conhecidas têm em comum a capacidade de tornar seus hospedeiros resistentes à estreptomicina , um ponto que poderia lançar luz sobre o fenômeno crescente da resistência aos antibióticos . O tratamento antibiótico com estreptomicina, portanto, favorece indiretamente a bactéria hospedeira, sabidamente patogênica para o homem.