O polimorfismo de nucleótidos (PN) ou polimorfismo de um único nucleótido (PSN) (único polimorfismo de nucleótidos em Inglês) é, em genética , a variação ( polimorfismo ) de uma única base par do genoma entre indivíduos da mesma espécie . A variação deve estar localizada em um local específico no genoma e aparecer em uma proporção maior que 1% da população para ser caracterizada como PNH. Essas variações são muito frequentes (aproximadamente um par de bases em mil no genoma humano).
Os NHPs representam 90% de toda a variação genética humana, e os NHPs com frequência alélica maior que 1% estão presentes a cada cem a trezentos pares de bases em média no genoma humano, onde dois em cada três NHPs substituem a citosina por timina .
Os NHPs estão na raiz das diferenças em nossa suscetibilidade às doenças; isso é válido para uma ampla gama de doenças humanas, incluindo anemia falciforme , β- talassemia e fibrose cística.A gravidade das doenças e a forma como nosso corpo responde aos tratamentos também são manifestações dessa variação genética . Por exemplo, uma mutação de um único par de bases no gene Apo E ( Apolipoproteína E ) está associada a um risco maior de doença de Alzheimer .
Os NHPs podem ser encontrados em regiões codificantes de genes ( exon ), regiões não codificantes de genes ( íntron ) ou regiões intergênicas entre os genes. No caso em que os NHPs se encontram dentro das regiões codificantes, esta não modificará necessariamente a sequência de aminoácidos da proteína produzida, graças à redundância do código genético .
NHPs que são encontrados em regiões não codificantes podem ter consequências no splicing , fatores de transcrição ou em sequências de RNA não codificantes .
Falaremos de formas alélicas sinônimas no caso em que várias formas de um NHP levam à mesma sequência polipeptídica , e de formas não sinônimas no caso em que as sequências produzidas diferem. Claro, isso só se aplica às regiões de codificação do genoma. Na linguagem cotidiana, falaremos então de "mutações sinônimas / não sinônimas".
Os PNHs são ferramentas para identificar genótipos (reconhecendo pessoas, por exemplo) a partir de amostras de matéria orgânica ou ajudando a construir árvores genealógicas de seres vivos ou espécies.
Em média, um NHP é encontrado a cada 100 a 1000 nucleotídeos. Existem na ordem de 5 × 10 6 no genoma humano. Certas associações de NHPs são características de certas populações. A distribuição dos NHPs é aleatória. Em qualquer gene, você pode esperar uma média de 10 NHPs, mas alguns podem não ter nenhum. Em 2001, havia 800.000 NHPs no genoma humano.
Cromossoma | Número de NHPs |
Cromossoma | Número de NHPs |
Cromossoma | Número de NHPs |
---|---|---|---|---|---|
1 | 16.759 | 9 | 5.790 | 17 | 6.392 |
2 | 12.748 | 10 | 6.014 | 18 | 2.682 |
3 | 10 112 | 11 | 6.931 | 19 | 7 664 |
4 | 6.995 | 12 | 7 375 | 20 | 5 381 |
5 | 9 146 | 13 | 2.847 | 21 | 3.478 |
6 | 13 888 | 14 | 5.827 | 22 | 5.400 |
7 | 12.389 | 15 | 4 343 | X | 3.253 |
8 | 4 962 | 16 | 5.771 | Y | 63 |
Total | 177.594 |