Antiparalelismo (bioquímica)

Em bioquímica , diz-se que dois biopolímeros são antiparalelos se forem orientados paralelamente um ao outro, mas na direção oposta. Os dois principais exemplos dessa configuração molecular são a dupla hélice do DNA e a folha β de proteínas .

Ácidos nucleicos

A direção das moléculas de ácido nucléico é convencionalmente definida pelos átomos de carbono da ribose (para RNA ) e desoxirribose (para DNA ) carregando um grupo fosfato -PO 3 2-em 5 'e um grupo hidroxila -OH em 3'. Assim, as RNA polimerases e as DNA polimerases sintetizam esses ácidos nucléicos sempre na direção 5 'para 3' .

No entanto, as duas fitas de DNA que compõem a dupla hélice são orientadas em direções opostas: cada extremidade da dupla hélice consiste na extremidade 5 ' de uma fita e na extremidade 3' da outra. Isso é importante durante a replicação do DNA  : uma das fitas da dupla hélice, chamada de fita avançada , é orientada na direção 3 'para 5', implicando em uma progressão da fita recém-formada na direção 5 '. 3', que é a da polimerização da polimerase, que pode então se replicar continuamente, enquanto a outra fita, chamada de fita retardadora , é orientada na direção oposta, de modo que, para ele, a polimerização da fita neoformada ocorre no período de 3 'a Direção 5 ', que só pode ser feita em fragmentos, chamados fragmentos de Okazaki , cada fragmento sendo produzido na direção 5' para 3 ':

Polipeptídeos

Os polipeptídeos têm uma extremidade N -terminal e extremidade C -terminal definido pelo grupo funcional livre para o fim em questão: amina -NH 2Lado do terminal N e lado do terminal C carboxil- COOH . A biossíntese de proteínas tem lugar a partir da extremidade N -terminal para a extremidade C -terminal , e que está na mesma direcção que é convencionalmente representada a sequência de aminoácidos dos péptidos .

Muitas proteínas têm os chamados domínios de “ folha β ”  em sua estrutura secundária . Essas folhas consistem em cadeias polipeptídicas orientadas paralelamente umas às outras, na mesma direção ou na direção oposta: neste último caso, as cadeias polipeptídicas da folha β são consideradas antiparalelas.

Notas e referências