O capitão do porto de São Tomé (também conhecido como gabinete do porto da Paraíba do Sul ) foi um dos quinze capitães do porto hereditário em que o Brasil foi inicialmente dividido durante a época colonial. Foi criado em 1536 e foi entregue a Pero de Góis .
Fazia fronteira com os atuais municípios de Cachoeiro de Itapemirim (no atual estado do Espírito Santo ) e Macaé (no estado do Rio de Janeiro ).
Seu proprietário fundou uma colônia e embarcou no cultivo da cana-de-açúcar , mas sua atividade foi rapidamente ameaçada por populações indígenas hostis. Seu território permaneceu quase abandonado até 1619 , quando a capitania foi devolvida à coroa portuguesa e depois integrada à capitania do Rio de Janeiro .