A conjugação cruzada é um tipo especial de conjugação em uma molécula quando três ligações π que podem interagir, ambas interagem entre si por conjugação e a terceira é excluída da interação. Em termos clássicos, isso significa que a alternância estrita de ligações duplas - CH = CH - CH = CH - CH-- (isto é, conjugado) é interrompida por duas ligações simples consecutivas em cada ponto de conjugação cruzada - CH = CH - C (= CH ) –CH = CH--. Exemplos de conjugação cruzada podem ser encontrados em moléculas como benzofenona , divinil cetonas , para quinonas , dendralenos e radialenos , fulerenos ou indigotina .
Este tipo de conjugação tem impacto na reatividade e nas transições eletrônicas moleculares.