OpenBabel
OpenBabel
| Desenvolvido por | a equipe de desenvolvimento do OpenBabel |
|---|---|
| Última versão | 3.1.1 (8 de maio de 2020) |
| Depósito | github.com/openbabel/openbabel |
| Escrito em | C ++ |
| Sistema operacional | Microsoft Windows |
| Meio Ambiente | Plataforma cruzada |
| Formatos de leitura | Chemical Markup Language , International Chemical Identifier , MDL Molfile ( d ) , Protein Data Bank ( en ) , FASTA , Alchemy Format ( d ) , Gaussian Cube File ( d ) , CDX Format ( en ) , Crystallographic Information File , Format .xyz , Formato fracional de forma livre ( d ) e formato MCDL ( d ) |
| Formatos escritos | Simplificada de entrada Molecular Linha Especificação Entrada , Chemical Markup Language , International Chemical Identificador , InChIKey ( d ) , MDL Molfile ( d ) , Bairros multinível de formato Atoms ( d ) , formato de forma livre Fractional ( d ) , o formato MCDL ( d ) e Cache MolStruct ( d ) |
| línguas | Multilíngue |
| Modelo |
Biblioteca de software Software de química ( d ) |
| Licença | GNU General Public License versão 2 ou posterior ( d ) |
| Local na rede Internet | openbabel.sourceforge.net |
O software livre OpenBabel é um sistema especialista utilizado principalmente em aplicações de quimioinformática para conversão de arquivos de estruturas químicas. Este software está disponível para Windows , Unix e Mac OS . É distribuído sob a licença GNU GPL .
O objetivo do projeto de ciência Open Babel é fornecer aos usuários e desenvolvedores um conjunto de programas de plataforma cruzada e bibliotecas projetadas para modelagem molecular, química e muitos campos relacionados, como conversão de formato de arquivo e dados.
Histórico
OpenBabel e JOELib são derivados da biblioteca de software OELib. O OELib foi baseado em conceitos do programa Babel e da biblioteca de software Obabel .
Principais características
- Sistema especialista em química
- Interconvertendo muitos formatos de arquivo de dados químicos.
- Pesquise subestruturas (com base em descritores SMARTS )
- Cálculo de pegadas binárias
- Adaptador Python
- Adaptador Perl
Notas e referências
- " Versão 3.1.1 " ,8 de maio de 2020(acessado em 9 de maio de 2020 )
Apêndices
Bibliografia
- The Blue Obelisk-Interoperability in Chemical Informatics , Rajarshi Guha, Michael T. Howard, Geoffrey R. Hutchison, Peter Murray-Rust, Henry Rzepa, Christoph Steinbeck, Jörg K. Wegner e Egon L. Willighagen, J. Chem. Inf. Modelo. ; 2006 ; DOI : 10.1021 / ci050400b
Artigos relacionados
- Ghemical , um programa de mecânica molecular baseado em OpenBabel
- JOELib , versão Java do OpenBabel / OELib
- XDrawChem , programa de desenho molecular 2D baseado em OpenBabel
links externos
- (en) Site OpenBabel
- (pt) " Home of the OpenBabel project " , em SourceForge.net .
- (pt) E-BABEL Versão interativa do OpenBabel hospedada no Virtual Computational Chemistry Laboratory
- ( fr ) Geoff Hutchison, um dos principais desenvolvedores do projeto, foi entrevistado no poadcast chemCast Episódio 003
- (in) falhas de design de software OELib