O septo (também chamado de "núcleos septais" ou "córtex septal") em questão aqui não é o septo pelúcido , mas uma área vizinha (área de Brodmann 25) localizada na parte inferior do aspecto medial do lobo frontal. E sob o porção anterior do corpo caloso (giro subcaloso). É o ponto culminante da faixa olfatória medial . Os núcleos septais são uma área estreita do cérebro, na frente do tálamo, abaixo do corpo caloso. Os núcleos profundos (núcleos do septo, nucleus accumbens ) mantiveram, talvez em detrimento das finalidades olfativas, uma atividade impulsiva e motivadora viva. Eles são elementos muito ativos da fisiologia do sistema límbico (atração, apetite, satisfação). Eles estão envolvidos na preservação da espécie, uma vez que sua estimulação leva a várias manifestações sexuais. Em humanos, por exemplo, a estimulação da área septal leva a sensações próximas ao orgasmo.
As aferências dos núcleos septais vêm da amígdala , do trato olfatório , do hipocampo , do hipotálamo e do tronco cerebral . As duas principais projeções eferentes são a estria medular e a via septo-hipocampal (em direção ao hipocampo).
Em animais, as lesões na região septal produzem excitabilidade e aumento das reações agressivas.