APOBEC

APOBEC é o acrônimo para "  Enzima de edição de mRNA de apolipoproteínas B , semelhante a polipeptídeo catalítico  " (" enzima de edição de mRNA de apolipoproteína B, que se comporta como um polipeptídeo catalítico  ").
APOBEC designa uma família de citidina desaminases , conservada de forma evolutiva.

A edição de mRNA é um dos mecanismos geradores de diversidade protéica. Os membros desta família de proteínas são enzimas de edição C-para-U, isto é, citidina para uridina .

O terminal N das proteínas do tipo APOBEC é um domínio catalítico, enquanto o terminal C é um domínio pseudocatalítico. Mais especificamente, o domínio catalítico é um domínio de citidina desaminase dependente de zinco e é essencial para a desaminação de citidina. A edição de RNA por APOBEC-1 requer homodimerização e este complexo interage com proteínas de ligação de RNA para formar o editossomo .

Funções

Em humanos / mamíferos , eles ajudam a proteger contra infecções virais . Mas essas enzimas, quando mal reguladas, são a principal fonte de mutação em muitos tipos de câncer .

aspectos estruturais e biofísicos

Uma revisão de 2013 discutiu os aspectos estruturais e biofísicos das enzimas da família APOBEC3.

No caso do COVID-19?

A edição de RNA por desaminases do hospedeiro é um processo de restrição inato contra muitas infecções virais , mas em junho de 2020 ainda não se sabia se esse processo funcionava contra coronavírus .

Ao estudar as sequências de RNA retiradas de amostras de fluidos de lavagem broncoalveolar de pacientes infectados com coronavírus, podem ser observadas alterações de nucleotídeos que podem ser "assinaturas" de edição de RNA:

A análise mutacional dos genomas de diferentes cepas de Coronaviridae de hospedeiros humanos revela perfis de mutação consistentes com aqueles observados em dados transcriptômicos, mas a redução da assinatura ADAR nesses dados aumenta a possibilidade de que ADARs podem ser mais eficientes do que APOBECs para limitar a disseminação viral.

Um estudo publicado em 2020 concluiu que tanto APOBECs quanto ADARs estão envolvidos na edição do genoma do coronavírus, um processo que pode moldar o destino do vírus e do paciente.

Aspectos genéticos relacionados aos membros desta família

Os genes humanos que codificam membros de proteínas da família APOBEC incluem:

Notas e referências

  1. (em) Joseph E. Wedekind , Geoffrey SC Dance , Mark.P. Sowden e Harold æC. Smith , “  Edição de RNA mensageiro em mamíferos: novos membros da família APOBEC em busca de papéis nos negócios da família  ” , Trends in Genetics , vol.  19, n o  4,abril de 2003, p.  207–216 ( DOI  10.1016 / S0168-9525 (03) 00054-4 , ler online , acessado em 22 de junho de 2020 )
  2. (en-US) "  Inesperado mecanismo de ligação de DNA sugere maneiras de bloquear a atividade enzimática em câncer  " , em GEN - Genetic Engineering and Biotechnology News ,20 de dezembro de 2016(acessado em 22 de junho de 2020 )
  3. Ananda Ayyappan Jaguva Vasudevan e Sander HJ Smits , "  Structural features of antiviral DNA cytidine deaminases  " , em Biological Chemistry ,1 r nov 2013( ISSN  1437-4315 , DOI  10.1515 / hsz-2013-0165 , consultado em 22 de junho de 2020 ) ,p.  1357–1370
  4. (en) Salvatore Di Giorgio , Filippo Martignano , Maria Gabriella Torcia e Giorgio Mattiuz , “  Evidência para edição de RNA dependente de hospedeiro no transcriptoma de SARS-CoV-2  ” , Science Advances , vol.  6, n o  25,junho de 2020, eabb5813 ( ISSN  2375-2548 , DOI  10.1126 / sciadv.abb5813 , ler online , acessado em 25 de junho de 2020 )

Veja também

Artigos relacionados

Bibliografia