Caenorhabditis
Caenorhabditis
Hermafrodita adulto
Caenorhabditis elegans .
Gentil
Caenorhabditis ( Osche (d) , 1952 ) Dougherty , 1955
Sinônimos
Caenorhabditis é um gênero de nematóides que vive em ambientes ricos em bactérias . Ele contém o organismo modelo Caenorhabditis elegans , bem como muitas outras espécies cujo genoma foi sequenciado.
O nome é formado a partir das duas raízes gregas caeno- (καινός (caenos), recente) e rhabditis (ῥάβδος (rhabdos), haste, pau).
Lista de espécies
De acordo com o NCBI (30 de outubro de 2019) , o gênero pertence à subfamília Peloderinae com os gêneros Pellioditis e Pelodera , e inclui as seguintes espécies:
- Caenorhabditis Afra
- Angaria de Caenorhabditis
- Caenorhabditis astrocarya
- Caenorhabditis Becei
- Caenorhabditis brenneri
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Caenorhabditis briggsae
- Caenorhabditis briggsae AF16
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Caenorhabditis briggsae x Caenorhabditis nigoni
- Caenorhabditis castelli
- Caenorhabditis dolens
- Caenorhabditis doughertyi
- Caenorhabditis drosophilae
- Caenorhabditis elegans
- Caenorhabditis guadeloupensis
- Caenorhabditis imperialis
- Caenorhabditis inopinata
- Caenorhabditis japonica
- Caenorhabditis kamaaina
- Caenorhabditis latens
- Macrosperma Caenorhabditis
- Caenorhabditis maupasi
- Caenorhabditis monodelphis
- Caenorhabditis nigoni
- Caenorhabditis nouraguensis
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Caenorhabditis nouraguensis x Caenorhabditis becei
- Caenorhabditis panamensis
- Caenorhabditis parvicauda
- Caenorhabditis plicata
- Caenorhabditis portoensis
- Caenorhabditis quiockensis
- Caenorhabditis remanei
- Caenorhabditis sinica
- Caenorhabditis sonorae
- Caenorhabditis sulstoni
- Caenorhabditis tribulationis
- Caenorhabditis tropicalis
- Caenorhabditis uteleia
- Caenorhabditis virilis
- Caenorhabditis vivipara
- Caenorhabditis waitukubuli
- Caenorhabditis wallacei
- Caenorhabditis yunquensis
- Caenorhabditis zanzibari
outras espécies não nomeadas de Caenorhabditis :
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Caenorhabditis sp. 1 TAC-2019
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Caenorhabditis sp. 1 TWN1898
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Caenorhabditis sp. 10 JR-2014
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Caenorhabditis sp. 10 TWN510
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Caenorhabditis sp. 11 RJ-2013
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Caenorhabditis sp. 16 NG-2017
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Caenorhabditis sp. 2 KK-2011
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Caenorhabditis sp. 2 TWN2542
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Caenorhabditis sp. 21 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 23 DC-2012
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Caenorhabditis sp. 26 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 3 TWN2594
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Caenorhabditis sp. 31 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 32 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 38 MB-2015
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Caenorhabditis sp. 39 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 4 TWN1772
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Caenorhabditis sp. 40 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 43 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 5 GVDU-2019
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Caenorhabditis sp. 6 TWN1824
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Caenorhabditis sp. 7 GVDU-2019
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Caenorhabditis sp. 8 KK-2011
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Caenorhabditis sp. 8 TWN1907
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Caenorhabditis sp. 9 AC-2009
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Caenorhabditis sp. 9 TWN2033
- Caenorhabditis sp. DF5070
- Caenorhabditis sp. JLR-2009
- Caenorhabditis sp. JU727
- Caenorhabditis sp. SB341
De acordo com o ITIS (27 de março de 2011) :
Genético
Lista de espécies sequenciadas
Estudos filogenéticos
Cladograma de espécies de Caenorhabditis de acordo com Félix et al. (Abril de 2014)
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Caenorhabditis
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Elegans
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C. inesperado
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C. sp. 35
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| Elegans
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C. wallacei
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C. tropicalis
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C. brenneri
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C. doughertyi
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C. elegans
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| Japonica
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C. nouraguensis
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C. yunquensis
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C. macrosperma
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C. japonica
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C. kamaaina
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| Drosófilas
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C. monodelphis
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C. plicata
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Cladograma de espécies de Caenorhabditis , baseado na comparação de sequências do " Espaçador transcrito interno ", porção do DNA localizada entre os genes da subunidade pequena e grande do RNA.
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Um estudo filogenético realizado em 2014 revelou a presença de dois supergrupos, 'Elegans' e 'Drosophilae, e dois grupos (' Elegans 'e' Japonica ') dentro do supergrupo' Elegans '. Este estudo também revela que C. nigoni é a espécie irmã de C. briggsae, enquanto C. elegans é única, basal no grupo 'Elegans'.
Outro estudo de 2019 adiciona C. inopinata como a espécie mais próxima de C. elegans . Também revela que C. monodelphis é a espécie mais basal na árvore filogenética.
Notas e referências
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(em) Osche, G., 1952. "Phylogeny Systematik und der Gattung Rhabditis (Nematoda)." Zoologische Jahrbücher (Abt. 1), 81, p. 190–280 .
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NCBI , acessado em 30 de outubro de 2019.
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ITIS , acessado em 27 de março de 2011
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(en) Stein, LD et al. , " The Genome Sequence of Caenorhabditis briggsae : A Platform for Comparative Genomics " , PLoS Biology , vol. 1, n o 22003, p. 166–192 ( PMID 14624247 , PMCID 261899 , DOI 10.1371 / journal.pbio.0000045 , ler online )
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(em) The C. elegans Sequencing Consortium, " Genome sequence of the nematode C. elegans : a platform for Investigating biology " , Science , vol. 282,1998, p. 2012–2018 ( DOI 10.1126 / science.282.5396.2012 , leia online )
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(em) Felix, Marie-Anne; Braendle, cristão; Cutter, Asher D. (11 de abril de 2014). "Um sistema simplificado para diagnóstico de espécies em Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) com designações de nome para 15 espécies biológicas distintas". PLOS ONE. 9: e94723. DOI : 10.1371 / journal.pone.0094723
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(en) Genômica comparativa de 10 novas espécies Caenorhabditis. Lewis Stevens, Marie - Anne Félix, Toni Beltran, Christian Braendle, Carlos Caurcel, Sarah Fausett, David Fitch, Lise Frézal, Charlie Gosse e Taniya Kaur, Evolution Letters, Volume 3, Issue2, April 2019, Pages 217-236, DOI : 10.1002 /evl3.110 .
links externos