Caenorhabditis

Caenorhabditis Descrição desta imagem, também comentada abaixo Hermafrodita adulto Caenorhabditis elegans . Classificação
Reinado Animalia
Galho Nematoda
Aula Secernentea
Pedido Rhabditida
Família Rhabditidae

Gentil

Caenorhabditis
( Osche  (d) , 1952 ) Dougherty , 1955

Sinônimos

Caenorhabditis é um gênero de nematóides que vive em ambientes ricos em bactérias . Ele contém o organismo modelo Caenorhabditis elegans , bem como muitas outras espécies cujo genoma foi sequenciado.

O nome é formado a partir das duas raízes gregas caeno- (καινός (caenos), recente) e rhabditis (ῥάβδος (rhabdos), haste, pau).

Lista de espécies

De acordo com o NCBI (30 de outubro de 2019) , o gênero pertence à subfamília Peloderinae com os gêneros Pellioditis e Pelodera , e inclui as seguintes espécies:

outras espécies não nomeadas de Caenorhabditis :

De acordo com o ITIS (27 de março de 2011)  :

Genético

Lista de espécies sequenciadas

Estudos filogenéticos

Cladograma de espécies de Caenorhabditis de acordo com Félix et al. (Abril de 2014)
Caenorhabditis

Elegans

C. inesperado



C. sp. 35


Elegans





C. briggsae



C. nigoni




C. sinica





C. latens



C. remanei






C. wallacei



C. tropicalis





C. brenneri



C. doughertyi





C. elegans



Japonica





C. nouraguensis



C. yunquensis




C. macrosperma





C. afra



C. imperialis





C. japonica




C. kamaaina




Drosófilas




C. drosophilae



C. sp. 2






C. angaria



C. castelli




C. sp. 8






C. portoensis



C. virilis





C. guadeloupensis






C. monodelphis



C. plicata




Cladograma de espécies de Caenorhabditis , baseado na comparação de sequências do " Espaçador transcrito interno ", porção do DNA localizada entre os genes da subunidade pequena e grande do RNA.

Um estudo filogenético realizado em 2014 revelou a presença de dois supergrupos, 'Elegans' e 'Drosophilae, e dois grupos (' Elegans 'e' Japonica ') dentro do supergrupo' Elegans '. Este estudo também revela que C. nigoni é a espécie irmã de C. briggsae, enquanto C. elegans é única, basal no grupo 'Elegans'.

Outro estudo de 2019 adiciona C. inopinata como a espécie mais próxima de C. elegans . Também revela que C. monodelphis é a espécie mais basal na árvore filogenética.

Notas e referências

  1. (em) Osche, G., 1952. "Phylogeny Systematik und der Gattung Rhabditis (Nematoda)." Zoologische Jahrbücher (Abt. 1), 81, p.  190–280 .
  2. NCBI , acessado em 30 de outubro de 2019.
  3. ITIS , acessado em 27 de março de 2011
  4. (en) Stein, LD et al. , "  The Genome Sequence of Caenorhabditis briggsae : A Platform for Comparative Genomics  " , PLoS Biology , vol.  1, n o  22003, p.  166–192 ( PMID  14624247 , PMCID  261899 , DOI  10.1371 / journal.pbio.0000045 , ler online )
  5. (em) The C. elegans Sequencing Consortium, "  Genome sequence of the nematode C. elegans : a platform for Investigating biology  " , Science , vol.  282,1998, p.  2012–2018 ( DOI  10.1126 / science.282.5396.2012 , leia online )
  6. (em) Felix, Marie-Anne; Braendle, cristão; Cutter, Asher D. (11 de abril de 2014). "Um sistema simplificado para diagnóstico de espécies em Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) com designações de nome para 15 espécies biológicas distintas". PLOS ONE. 9: e94723. DOI : 10.1371 / journal.pone.0094723
  7. (en) Genômica comparativa de 10 novas espécies Caenorhabditis. Lewis Stevens, Marie - Anne Félix, Toni Beltran, Christian Braendle, Carlos Caurcel, Sarah Fausett, David Fitch, Lise Frézal, Charlie Gosse e Taniya Kaur, Evolution Letters, Volume 3, Issue2, April 2019, Pages 217-236, DOI : 10.1002 /evl3.110 .

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