Ensembl é um sistema de bioinformática para anotação automática do genoma . É um projeto conjunto do Instituto Europeu de Bioinformática (EBI) e do Instituto Wellcome Trust Sanger, cuja ideia central é organizar vastos campos de informação biológica em torno de sequências genômicas .
Para cada genoma analisado, o Ensembl tenta identificar por um processo automático todos os genes que ele contém. Para isso, conta com dados de sequências existentes ( RNA , proteínas ), que “pendura” no genoma, para deduzir a estrutura dos genes.
Nesta primeira camada de anotação, a da estrutura dos genes, o Ensembl adicionará outros elementos, entre os quais:
Ensembl primeiro se apresenta como um "navegador de genomas" ( " Genome Browser " ) para explorar e visualizar diferentes níveis dos genomas de muitos organismos.
Ensembl também é um banco de dados aberto do qual se pode extrair livremente, seja diretamente, ou por meio de uma interface de programação , ou pelo sistema de interrogação BioMart.
Por fim, o Ensembl é uma infraestrutura de software aberta que permite construir diferentes sistemas de organização de dados relacionados a sequências genômicas.
O projeto Ensembl é impulsionado por uma cultura de ampla abertura, que se traduz em: