Uma viroporina é uma proteína viral pequena , multifuncional, geralmente hidrofóbica , que modifica as membranas plasmáticas e, portanto, facilita a liberação de vírions das células infectadas. As viroporinas são capazes de se reunir em canais iônicos ou poros oligoméricos na membrana plasmática da célula hospedeira , o que torna essa membrana mais permeável. Muitas viroporinas também exibem outros efeitos no metabolismo celular e na homeostase envolvendointerações proteína-proteína com proteínas da célula hospedeira. Eles não são necessariamente essenciais para a replicação viral, mas a promovem significativamente. Eles são encontrados em uma variedade de genomas, mas estão particularmente presentes em vírus de RNA . Muitos vírus causam doenças da expressão humana de virporinas, como a hepatite C , o HIV ( HIV-1 ), o vírus da influenza A , o vírus da poliomielite , o vírus sincicial respiratório e o coronavírus da síndrome respiratória aguda grave ( SARS-CoV ).
As viroporinas são geralmente proteínas de 100 a 120 resíduos de aminoácidos e contêm pelo menos um domínio capaz de dobrar em hélice transmembranar anfifílica . Alguns contêm aminoácidos básicos da cadeia lateral ou segmentos com resíduos aromáticos que se acredita estarem localizados na interface com a membrana. Dos oligômeros dessas proteínas, na maioria das vezes os tetrâmeros , formam canais iônicos ou poros com seletividade iônica geralmente baixa, o que permite a difusão dos íons através da membrana plasmática . A arquitetura molecular do poro, sua seletividade iônica, seu nível de integração na membrana celular e sua possível extensão em ambos os lados dessa membrana são parâmetros que variam muito de uma viroporina para outra, o que indica que essas proteínas têm papéis funcionais diversos.
É possível classificar as viroporinas em quatro classes de acordo com sua topologia e orientação na membrana. As viroporinas de classe I têm uma única hélice transmembrana, enquanto as de classe II exibem um padrão de hélice-cotovelo-hélice em que ambas as hélices cruzam a membrana. A subclasse I A corresponde a viroporinas com uma única hélice transmembrana cuja extremidade C- terminal está localizada no lado do citosol , enquanto a subclasse I B corresponde a viroporinas orientadas na outra direção, com a extremidade N- terminal . Lado do citosol. Da mesma forma, a subclasse II A corresponde a viroporinas cuja curva é orientada para o citosol e ambas as extremidades do peptídeo são orientadas para fora dele - para o meio extracelular no caso de uma membrana plasmática ou para o lúmen do citosol. Retículo endoplasmático ou vesícula no caso do sistema de endomembrana - enquanto a subclasse II B corresponde a viroporinas orientadas na direção oposta. No entanto, há exceções a esse padrão, como a proteína 4 não estrutural de rotavírus ( NSP4 (en) ) .