RNA polimerase II

A RNA polimerase II ( RNAP II ou Pol II ) é uma nucleotidiltransferase presente nas células de eucariotos . É uma das RNA polimerases desses organismos, junto com a RNA polimerase I , a RNA polimerase III e a RNA polimerase IV . Ela realiza a transcrição do DNA para produzir o RNA pré-mensageiro e a maioria dos pequenos RNAs nucleares e microRNAs . É um complexo proteico de 550  kDa que requer um grande número de fatores de transcrição para se ligar ao promotor e iniciar a transcrição.

A RNA polimerase II consiste em 10 a 12 subunidades (12 em leveduras e em humanos ), entre as quais várias interações foram identificadas:

• O dependente de ADN RPB1 ARN polimerase II subunidade - Codificado em seres humanos pela POLR2A gene e, em levedura, pelo RPO21 gene . É a maior subunidade da RNA polimerase II. Ele contém um terminal C de domínio compreendendo até 52 repetições de um padrão de sete  resíduos de aminoácidos Tyr - Ser - Pro - Thr - Ser - Pro - Ser essenciais para a atividade da polimerase . Ele forma, junto com outras subunidades, o domínio que se liga ao DNA, na forma de uma fenda na qual o molde do DNA é transcrito em RNA. Ele interage fortemente com a subunidade PRB8.

• A subunidade PRB2 - esta é a segunda maior subunidade da enzima. Com pelo menos duas outras subunidades, constitui a estrutura que mantém em contato, no sítio ativo da enzima, o molde de DNA e o RNA recém-sintetizado.

• A subunidade PRB3 - esta é a terceira maior subunidade da enzima. Ele existe como um heterodímero com outra subunidade da polimerase, formando um subconjunto com a cadeia POLR2J. Ele interage fortemente com as subunidades RPB1-5, 7 e 10-12.

• A subunidade RPB4 (gene POLR2D ) - Teria um papel protetor contra o estresse.

• A subunidade RPB5 (gene POLR2E ) - Cada RNA polimerase II conta em duplicata. Ele interage fortemente com as subunidades RPB1, 3 e 6.

• A subunidade RPB6 - junto com pelo menos duas outras subunidades, forma uma estrutura que estabiliza a polimerase no molde de DNA durante a transcrição.

• A subunidade RPB7 (gene POLR2G ) - Pode desempenhar um papel regulador. Ele interage fortemente com o RPB1 e 5 subunidades.

• A subunidade RPB8 (gene POLR2H ) - Interage com as subunidades RPB1-3, 5 e 7.

• A subunidade RPB9 (gene POLR2I ) - Junto com a subunidade RPB1, constitui a fenda na qual o molde de DNA se aloja durante a transcrição.

• A subunidade RPB10 (gene POLR2L ) - Interage com as subunidades RPB1-3 e 5, e em RPB3 absoluto.

• A subunidade RPB11 - ela própria é composta de três subunidades em humanos: POLR2J (RPB11-a), POLR2J2 (RPB11-b) e POLR2J3 (RPB11-c)

• A subunidade RPB12 (gene POLR2K ) - Também interage com a subunidade RPB3.

Notas e referências

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