Polaridade (ácido nucleico)

Em genética e biologia molecular , a polaridade de um ácido nucléico é negativa na fita transcrita em RNA mensageiro e é positiva na fita complementar. Uma fita de polaridade positiva é chamada de "  sentido  ", enquanto uma fita de polaridade negativa é  chamada de  " anti-sentido ". Às vezes chamado de "fita modelo" para se referir à fita antisense, mas este termo pode ser ambíguo na medida em que as duas fitas da mesma hélice dupla de DNA (ou de RNA em alguns vírus ) podem codificar proteínas diferentes; então falamos de fios " ambisens  ”.

Polaridade de DNA

A fita "  sentido  " de uma dupla hélice de DNA - fita com polaridade positiva - possui uma sequência nucleotídica semelhante ao RNA transcrito da fita complementar . Assim, uma sequência A T G em uma fita com sentido corresponde a uma sequência A U G no RNA. No entanto, não é a fita sense que é transcrita em RNA mensageiro , mas a fita   “ antisense ” - de polaridade negativa - que é complementar a ela.

Assim, um tripleto de base 5'- C A T -3 'na fita de DNA antisense pode servir como um molde a ser transcrito em um tripleto 5'- A U G -3' no RNA, uma vez que o pareamento entre as fitas complementares é antiparalelo . A fita de DNA sense, neste caso, carregaria o tripleto 5'- A T G -3 ': em geral, a fita de DNA sense carrega uma sequência semelhante à do RNA transcrito da fita d.' DNA antisense.

Polaridade de RNA

O vírus de RNA encadeado pode ter um genoma de direção positiva, direção negativa ou ambisense:

• direção positiva  : a sequência de genes no RNA viral é idêntica à dos RNAs mensageiros, capazes de serem traduzidos em proteínas . Alguns vírus desse tipo, como os coronavírus , podem produzir proteínas diretamente ao traduzir o RNA viral, sem precisar recorrer a uma RNA polimerase dependente de RNA .

• sentido negativo  : a sequência de genes no RNA viral é complementar àquela dos RNAs mensageiros, capazes de serem traduzidos em proteínas. Eles devem, portanto, primeiro ser transcritos em mRNA por uma RNA polimerase dependente de RNA que será então traduzida em proteínas porque não podem ser usados ​​diretamente para fazer isso. É o caso, por exemplo, do vírus Ebola e da gripe .

• ambisens  : os genes presentes no RNA viral podem ser, dependendo do caso, codificados positiva ou negativamente, de forma que algumas proteínas podem ser sintetizadas diretamente pelo RNA viral enquanto outras são sintetizadas a partir de um RNA mensageiro previamente produzido por um RNA dependente de RNA polimerase. Este é o caso dos bunyavírus, por exemplo .

Notas e referências

1. (em) Mary Nguyen e Anne-Lise Haenni , "  Expression of Strategies ambisense virus  " , Virus Research , vol.  93, n o  2 Junho de 2003, p.  141-150 ( PMID  12782362 , DOI  10.1016 / S0168-1702 (03) 00094-7 , ler online )
2. (em) Tetsuji Kakutani, Yuriko Hayano, Takaharu Hayashi e Yuzo Minobe , "  Ambisense segmento 3 do vírus da faixa de arroz: a primeira instância de um vírus contendo ambisense dois segmentos  " , Journal of General Virology , vol.  72, n o  2 Fevereiro de 1991, p.  465-468 ( PMID  1993885 , DOI  10.1099 / 0022-1317-72-2-465 , ler online )
3. (em) Yafeng Zhu, Takahiko Hayakawa, Shigemitsu Toriyama e Mami Takahashi , "  Complete nucleotide sequence of RNA 3 of rice stripe virus: an ambisense coding strategy  " , Journal of General Virology , vol.  72, n o  Parte 4, Abril de 1991, p.  763-767 ( PMID  2016591 , DOI  10.1099 / 0022-1317-72-4-763 , leia online )