Variantes SARS-CoV-2 Kappa e Delta
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As variantes B.1.617 , também chamadas de G / 452R. V3 e freqüentemente apelidado de " variante indiana ", são variantes do SARS-CoV-2 . Eles são identificados pela primeira vez em Maharashtra , Índia , em5 de outubro de 2020. Eles são identificados no clado 20A sob o sistema de classificação filogenética Nextstrain . A sub-linha B.1.617.1 é chamada de variante Kappa pela OMS , e a sub-linha B.1.617.2, a variante Delta .
"Duplo mutante"
Detectado em 5 de outubro de 2020perto de Nagpur, na Índia , a variante B.1.617 (.1) tem 15 mutações , duas das quais afetam o domínio de ligação da proteína espicular :
- L452R , detectado nas variantes B.1.427 / B.1.429 (Califórnia);
- E484Q , afetando o mesmo aminoácido da mutação E484K das variantes sul-africana e brasileira.
Essas duas últimas mutações são preocupantes porque podem permitir que escape de anticorpos (pós-infecção ou vacinas). Eles lhe renderam o - impróprio - qualificador de "duplo mutante".
a 10 de maio de 2021, esta variante B.1.617 foi classificada como "preocupante" pela OMS . a11 de maio de 2021, A OMS observa que "pode haver diferenças significativas entre as três sublininhas", mas que "os dados atualmente disponíveis são muito limitados" para poder diferenciá-los.
Casos de mucormicose são relatados na Índia em pacientes recuperados de Covid-19. No entanto, parece que é a combinação de diabetes tipo 2 e terapia com corticosteroides que enfraquece o sistema imunológico que promove a infecção mucoral e não o vírus SARS-CoV-2 em si.
a 31 de maio de 2021, A OMS adota letras gregas para nomear as variantes mais importantes, substituindo sua origem geográfica, potencialmente estigmatizante:
- a linha B.1.617.1 torna-se a variante Kappa e é rebaixada para a variante de interesse ;
- a linha B.1.617.2, a mais dinâmica, passa a ser a variante Delta, classificada como variante de interesse ;
- a terceira linha não é difundida fora da Índia.
A variante Delta desdobra na Europa ( 4 ª onda) em detrimento da variável Alpha . É caracterizado por:
- 2 substituições no domínio de ligação ao receptor celular ( L452R e T478K), facilitando a ligação ao receptor ACE2 ;
- 1 substituição perto do local de clivagem S1 / S2 por furina ( P681R ), facilitando a fusão com a membrana celular ;
- 1 substituição (T19R) e 1 deleção dupla (157-158del) no domínio antigênico NTD , contribuindo para o escape de anticorpos neutralizantes .
Espalhar
Em Abril de 2021, havia se espalhado para pelo menos oito países. Relatórios de campo o descrevem como mais contagioso.
Public Health France escreve sobre 8 de abril de 2021 : “Esta variante foi detectada esporadicamente na Inglaterra , Alemanha , Canadá e Cingapura . Dois casos foram detectados em Guadalupe . "
No final de abril, descobriu-se que essa variante estava circulando em Fiji . Foi trazido para lá por dois pacientes repatriados da Índia. Um soldado em um centro de quarentena foi infectado ao tocar em sua bagagem. Ele então infectou uma faxineira, que não informou às autoridades sobre os sinais clínicos de sua doença e saiu livremente do centro de quarentena, infectando muitas outras pessoas.
a 29 de abril de 2021, a agência regional de saúde da Nouvelle-Aquitaine anuncia que a variante indiana foi detectada pela primeira vez na França , no departamento de Lot-et-Garonne , em um paciente que retornou da Índia . No dia seguinte, a Direção-Geral da Saúde revelou que dois novos casos foram detectados em Bouches-du-Rhône e que outros casos suspeitos estão sendo investigados em outras regiões, ainda envolvendo pessoas da Índia .
Em Maio de 2021, alguns meios de comunicação consideram que a chamada variante indiana é mais contagiosa do que a chamada britânica. No Reino Unido , a chamada variante britânica representa apenas 90% dos vírus que se propagam contra 10% da chamada variante indiana.
No 8 de junho de 2021, o Reino Unido - em resposta à variante Delta que está substituindo outras variantes - recomenda oficialmente reduzir as viagens ao mínimo. A variante dobra o número de pessoas hospitalizadas no Reino Unido a cada semana, 90% das quais não foram vacinadas com duas doses.
Em Junho de 2021, a variante quintuplica a cada quinze dias o número de pessoas que realizaram testes de flash na França, ou seja, é multiplicado por 2,2 todas as semanas. a23 de junho de 2021, Gabriel Attal , porta-voz do governo, anuncia que essa variante representa de 9 a 10% das contaminações na França, mas que esse número é muito maior no departamento de Landes onde chega a 70%.
No entanto, na França, estamos procurando mutações em vez de variantes. a28 de junho, a mutação L452R aparece em 25,8% dos testes.
a 17 de julho, a propagação da variante delta na Espanha leva ao confinamento noturno em municípios catalães com mais de 5.000 habitantes.
No dia seguinte, os Pirenéus Orientais - departamento francês próximo à Catalunha - fecham bares , restaurantes , estabelecimentos de praia , estabelecimentos de bebidas temporárias e mercearias noturnas, das 23h00 às 18h00.
Em 23 de julho, Occitânia atingiu uma taxa de incidência de 200 por 100.000 e 651 por 100.000 entre 20-29 anos.
Problema relacionado à imunidade coletiva
Professor JF Delfraissy o9 de junho de 2021avaliou o número de reprodução básico R 0 da variante Delta em 7,5. O nível de imunidade coletiva necessário para que o vírus não se espalhe mais é, portanto, 1-1 / R 0, ou seja , 87%.
Eficácia das vacinas com a variante Delta
A eficácia das vacinas diminui com a variante Delta. De acordo com estudos britânicos e canadenses, é:
| Vacina | Após 1 injeção | Após 2 injeções |
|---|---|---|
| AstraZeneca | 30% | 67% |
| Pfizer-BioNTech | 36% | 88% |
| Moderna | 72% | WL |
Estatisticas
| Casos relatados por país (atualizado em 7 de julho de 2021) GISAID | ||
|---|---|---|
| País | Casos confirmados | Data de coleta |
| Índia | 3693 | 26 de maio de 2021 |
| Reino Unido | 517 | 31 de maio de 2021 |
| Estados Unidos | 299 | 24 de junho de 2021 |
| Canadá | 266 | 12 de maio de 2021 |
| Irlanda | 170 | 8 de junho de 2021 |
| Austrália | 112 | 15 de junho de 2021 |
| Alemanha | 106 | 22 de junho de 2021 |
| Cingapura | 59 | 13 de maio de 2021 |
| Dinamarca | 28 | 31 de maio de 2021 |
| Países Baixos | 27 | 12 de junho de 2021 |
| Japão | 27 | 7 de maio de 2021 |
| Angola | 24 | 20 de abril de 2021 |
| França | 16 | 20 de maio de 2021 |
| Bélgica | 16 | 13 de maio de 2021 |
| China | 13 | 18 de abril de 2021 |
| Catar | 12 | 17 de maio de 2021 |
| Coreia do Sul | 12 | 27 de abril de 2021 |
| suíço | 10 | 4 de maio de 2021 |
| Portugal | 9 | 4 de maio de 2021 |
| Itália | 9 | 24 de maio de 2021 |
| Bahrain | 8 | 10 de abril de 2021 |
| México | 8 | 2 de junho de 2021 |
| África do Sul | 8 | 18 de junho de 2021 |
| Finlândia | 7 | 23 de maio de 2021 |
| Luxemburgo | 6 | 26 de abril de 2021 |
| Espanha | 5 | 19 de maio de 2021 |
| Suécia | 5 | 17 de abril de 2021 |
| Gana | 5 | 20 de abril de 2021 |
| Quênia | 5 | 29 de abril de 2021 |
| República Checa | 4 | 4 de maio de 2021 |
| Jordânia | 4 | 25 de abril de 2021 |
| Myanmar | 4 | 2 de junho de 2021 |
| Nova Zelândia | 4 | 8 de abril de 2021 |
| Malásia | 4 | 1 de junho de 2021 |
| Indonésia | 3 | 29 de abril de 2021 |
| Guadalupe | 2 | 10 de março de 2021 |
| Malawi | 2 | 30 de abril de 2021 |
| Nepal | 2 | 9 de maio de 2021 |
| São Martinho | 2 | 3 de abril de 2021 |
| Botswana | 2 | 1 de junho de 2021 |
| Kuwait | 1 | |
| Áustria | 1 | |
| Camboja | 1 | 5 de abril de 2021 |
| Curaçao | 1 | 23 de abril de 2021 |
| Grécia | 1 | 6 de abril de 2021 |
| Eslováquia | 1 | 19 de abril de 2021 |
| Eslovênia | 1 | 6 de abril de 2021 |
| Tailândia | 1 | 26 de abril de 2021 |
| Uganda | 1 | 26 de março de 2021 |
| Zâmbia | 1 | 2 de maio de 2021 |
| Mundial (50 países) | Total: 5.525 | Total em 1º de julho de 2021 |
Notas e referências
Notas
- O número de mutações não está limitado a duas e o vírus não sofreu mutação duas vezes.
- Consulte fungo preto (complicação relacionada a COVID-19)
Referências
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