001 | Cola | Para o | Gln | Ilha | Thr | Gly | Arg | Pró | Cola | Trp |
011 | Ilha | Trp | Leu | Para o | Leu | Gly | Thr | Para o | Leu | Conheceu |
021 | Gly | Leu | Gly | Thr | Leu | Tyr | Phe | Leu | Val | Lírios |
031 | Gly | Conheceu | Gly | Val | Ser | Asp | Pró | Asp | Para o | Lírios |
041 | Lírios | Phe | Tyr | Para o | Ilha | Thr | Thr | Leu | Val | Pró |
051 | Para o | Ilha | Para o | Phe | Thr | Conheceu | Tyr | Leu | Ser | Conheceu |
061 | Leu | Leu | Gly | Tyr | Gly | Leu | Thr | Conheceu | Val | Pró |
071 | Phe | Gly | Gly | Cola | Gln | Asn | Pró | Ilha | Tyr | Trp |
081 | Para o | Arg | Tyr | Para o | Asp | Trp | Leu | Phe | Thr | Thr |
091 | Pró | Leu | Leu | Leu | Leu | Asp | Leu | Para o | Leu | Leu |
101 | Val | Asp | Para o | Asp | Gln | Gly | Thr | Ilha | Leu | Para o |
111 | Leu | Val | Gly | Para o | Asx | Gly | Ilha | Conheceu | Ilha | Gly |
121 | Thr | Gly | Leu | Val | Gly | Para o | Leu | Thr | Lírios | Val |
131 | Tyr | Ser | Tyr | Arg | Phe | Val | Trp | Trp | Para o | Ilha |
141 | Ser | Thr | Para o | Para o | Conheceu | Leu | Tyr | Ilha | Leu | Tyr |
151 | Val | Leu | Phe | Phe | Gly | Phe | Thr | Ser | Lírios | Para o |
161 | Glx | Ser | Conheceu | Arg | Pró | Cola | Val | Para o | Ser | Thr |
171 | Phe | Lírios | Val | Leu | Arg | Asn | Val | Thr | Val | Val |
181 | Leu | Trp | Ser | Para o | Tyr | Pró | Val | Val | Trp | Leu |
191 | Ilha | Gly | Ser | Cola | Gly | Para o | Gly | Ilha | Val | Pró |
201 | Leu | Asn | Ilha | Cola | Thr | Leu | Leu | Phe | Conheceu | Val |
211 | Leu | Asp | Val | Ser | Para o | Lírios | Val | Gly | Phe | Gly |
221 | Leu | Ilha | Leu | Leu | Arg | Ser | Arg | Para o | Ilha | Phe |
231 | Gly | Cola | Para o | Cola | Para o | Pró | Cola | Pró | Ser | Para o |
241 | Gly | Asp | Gly | Para o | Para o | Para o | Thr | Ser | ||
Sequência peptídica da bacteriorodopsina . |
A bacteriorodopsina é uma pequena proteína encontrada em certas arquéias , incluindo halobactérias , onde funciona como uma bomba de prótons usando a energia da luz para gerar um gradiente de prótons através da célula da membrana .
Esta proteína é encontrada em particular na membrana roxa da archaea halofílica Halobacterium salinarum .
Esta proteína de 248 aminoácidos está na forma de um homotrímero com simetria cilíndrica. Cada uma das três unidades idênticas tem uma estrutura de sete hélices α transmembrana - uma estrutura chamada opsina - prendendo um cromóforo , aqui uma molécula retinal ligada ao resíduo lisina 216 por uma base de Schiff protonada.
A molécula se comporta geralmente como uma bomba de prótons gerando uma diferença de pH entre a região extracelular e o interior da célula, gradiente de prótons que por sua vez permite a produção de ATP .
O bombeamento de prótons para fora da célula é acionado por mudanças conformacionais na bacteriorodopsina induzida pela alternância entre a forma 13- cis , 15- syn excitada e a forma all- trans , 15- anti no estado fundamental da retina .:
O mecanismo de bombeamento pode ser resumido da seguinte forma:
O retinal reprotonado recupera sua configuração all- trans e a proteína, cujas cargas elétricas internas foram reequilibradas, retorna à sua conformação inicial. Cada um desses fotociclos dura de 10 a 20 ms in vivo .
A simplicidade da bacteriorodopsina a tornou um modelo para o estudo da bioenergética e para o transporte por membrana . Também é de interesse para a indústria de armazenamento de dados , na medida em que pode servir como uma unidade de armazenamento extremamente miniaturizada controlável por pulsos de luz (na taxa de um bit por molécula, um disco de 12 cm de diâmetro pode conter de 20 a 50 TB ). O uso da bacteriorodopsina é uma das primeiras aplicações da eletrônica molecular orgânica, uma disciplina emergente na nanoinformática .