Marcador genético

O marcador genético é um gene ou sequência polimórfica de DNA facilmente detectável por uma localização conhecida em um cromossomo . Pode ser usado no mapeamento genético para “marcar” o genoma e identificar indivíduos ou espécies.

O marcador genético pode ser descrito como uma variação (que pode ocorrer devido a mutação ou alteração dos loci genômicos) que pode ser observada. Um marcador genético pode ser uma sequência curta de DNA, como uma sequência em torno de um único par de bases (polimorfismo de nucleotídeo único, SNP ) ou sequências repetidas ( VNTR ), como minissatélites .

Até 1980 , os marcadores genéticos eram morfológicos porque se baseavam apenas em genes polimórficos mapeados a partir da análise de fenótipos . Novas biotecnologias ( PCR, etc.) permitem a análise direta do polimorfismo de sequências de DNA para a elaboração de um mapa genético ( marcadores moleculares - diretamente DNA - ou bioquímicos).

Tipos de marcadores

Existem diferentes tipos de marcadores:

• RFLP , Polimorfismo de Comprimento de Fragmento de Restrição,
• AFLP , polimorfismo de comprimento de fragmento amplificado
• SSLP , polimorfismo de comprimento de sequência simples
• RAPD , amplificação aleatória de DNA polimórfico
• SNP , polimorfismo de nucleotídeo,
• SSCP , polimorfismo conformacional de fita simples
• EST , marcador de sequência expressa,
• CNV , Variabilidade do número de cópias,
• VNTR , sequência repetida
  • SSR (repetição de sequência simples) ou polimorfismo de microssatélites ,
  • minissatélite ,
  • STS , site com tag de sequência

Características

De acordo com Bretting e Widrlechner (1995), as condições ideais para um marcador genético são:

• ser polimórfico , para poder diferenciar facilmente entre indivíduos ou linhagens;
• ser relativamente "neutro", tanto em termos do valor do traço estudado, quanto do valor seletivo  ;
• ser codominante , para distinguir heterozigotos de homozigotos  ;
• ser um traço mendeliano herdado simples;
• não ser pleiotrópico ou epistático  ;
• ser disperso ao longo do genoma;
• não estar vinculado a outro marcador;
• ser estável, independente do estágio de desenvolvimento;
• não tem nenhum impacto no crescimento ou reprodução sexual;
• ser facilmente observável, sem ambigüidade possível;
• seja barato;

Classificação de marcadores

Eles podem ser classificados em três grupos, dependendo se revelam:

• a codominância ou alelo dominante
• polimorfismo de sequências ou unidades de repetição
• um locus , uma determinada região ou regiões inteiras ( perfil genético , mapas genéticos saturados).

Notas e referências

1. Daniel Prat & al, Análise de genoma e gestão de recursos genéticos florestais [ leia online ] , pp. 73-74, ed. Quae, 2006, 456 p. ( ISBN  2738012272 ) .
2. D. De Vienne e S. Santoni , "  The main sources of molecular markers  ", Molecular markers in genetics ,1998, p.  49-79

Não deve ser confundido

• Gene marcador , servindo como um controle para a transformação genética,
• Marcador biológico , testemunha de distúrbios ecológicos,